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DeCS.es presenta una navegación en niveles jerárquicos del "Vocabulario estructurado de Descriptores en Ciencias de la Salud". Dicho vocabulario indica la traducción del descriptor en inglés y portugués, asi como su definición, sinónimos, y los calificadores permitidos para cada término. La navegación se realiza en base a las siguientes categorías principales:

- Descriptores de anatomía.
- Descriptores de antropología, educación, sociología y fenómenos sociales.
- Descriptores de atención de salud.
- Descriptores de características de publicaciones.
- Descriptores de ciencias biológicas.
- Descriptores de ciencia y salud.
- Descriptores de ciencias de la información.
- Descriptores de ciencias naturales.
- Descriptores de compuestos químicos y drogas.
- Descriptores de denominaciones de grupos.
- Descriptores de denominaciones geográficas.
- Descriptores de enfermedades.
- Descriptores de homeopatía.
- Descriptores de humanidades.
- Descriptores de organismos.
- Descriptores de psiquiatría y psicología.
- Descriptores de salud pública.
- Descriptores de técnicas y equipos.
- Descriptores de tecnología, industria, agricultura.
- Descriptores de vigilancia sanitaria.

El vocabulario estructurado DeCS fue creado para su uso en la indización de artículos de revistas científicas, libros, anales de congresos, informes técnicos, y otros tipos de materiales, así como para ser usado en la búsqueda y recuperación de asuntos de la literatura científica en diferentes bases de datos médicas.